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　　腸炎：為金鱒稚魚常見病，主要危害5克以下的稚魚。癥狀：主要是腸管發炎，充血，無食物，常充滿白色或黃色粘液。防治方法：主要是藥餌防治，可制作抗生素藥餌等進行防治。復方新諾明用量100毫克/千克魚體重，連續投喂5天～7天，第1天藥量加倍。
　　腹脹：主要危害上浮仔魚到5克/尾的金鱒苗種。癥狀：病魚腹部明顯腫脹，胃內有飼料和水。防治方法：減少投喂量；投喂氟苯尼考藥餌，用量15毫克/千克～30毫克/千克魚體重，連續投喂5天～7天。
　　爛鰭：金鱒苗種相對于虹鱒苗種更容易發生爛鰭病，主要危害10克/尾～50克/尾的苗種，可造成少量死亡。癥狀：病魚背鰭前部腫脹發炎，出現出血病灶。防治方法：降低養殖密度，用1ppm溴海因（10%）浸洗40分鐘～60分鐘；或投喂藥餌，用量每100千克魚體重加8克～20克土霉素，連續投喂5天～7天；內服外用結合效果更佳。
　　鼓眼：主要是養殖水中氮氣含量較高引起，危害10克/尾～50克/尾的苗種，可造成少量死亡。癥狀：病魚眼球突出，個別眼球壞死，或脫落。防治方法：增加養殖用水溶解氧。
　　爛鰓：此病為金鱒苗種培育中最常見的細菌性疾病，主要危害從上浮仔魚到10克/尾左右的魚種。在飼養密度過高、水中氨態氮含量增加、溶解氧下降、水質混濁等條件下，容易引起該病的發生。主要癥狀：病魚食欲減退或停止進食，不活潑，鰓蓋外張，慢游在池邊和排水口。鰓部分泌大量粘液，鰓絲腫脹，鰓蓋閉合不正常，鰓絲末端發白，個別鰓絲有出血點，并局部褪色，死魚逐漸增加，死亡魚嘴部張開。預防方法：降低魚的飼養密度，增加水流量與溶氧，保持魚池水質清潔，減少氨態氮等有害物質的刺激，適當控制飼料投喂量，避免過度飽食。小心管理操作，尤其是遇暴雨或分級、挪池后應用適當藥物消毒，減少細菌感染的機會。治療方法：以外用消毒和內服相全抬。用1%～2%食鹽浸洗30分鐘，浸洗1次～3次；或用0.5ppm～1ppm聚維酮碘浸洗30分鐘～60分鐘，浸洗1次～3次；或用0.5ppm～1ppm二溴海因（10%）浸洗30分鐘～60分鐘，消毒次數可根據魚苗體質和發病情況靈活掌握。內服抗生素類，如每100千克魚體重加8克～20克土霉素制作藥餌投喂等。
　　小瓜蟲：又稱白點病，對苗種危害較大，是一種流行廣、感染率高、危害大的纖毛蟲病，如不及時治療，會造成大批死亡。主要癥狀：小瓜蟲寄生在金鱒的體表、鰭條、口腔、眼球和鰓體中。寄生在體表和鰭條時，寄主受刺激分泌粘液包圍，形成白色囊泡，呈現出許多小于1毫米小白點。寄生在眼球，可使眼球渾濁、發白。寄生在鰓上，引起鰓上皮細胞增生，粘液分泌增多，鰓絲粘連、糜爛，引起繼發性爛鰓和鰓霉病。病魚常側身磨體，表現不安，貼池邊游動，食欲減退，出現死亡。預防方法：預防小瓜蟲病，應該和小瓜蟲的生活史相結合。小瓜蟲是一種原蟲，由感染魚或攜帶蟲體的其它生物、器械帶入魚池，或隨養殖水源進入魚池。成熟的蟲體離開病魚后立即形成胞囊，粘附在魚池底、壁或其它固體表面，胞囊內逐漸分裂成許多個體，即幼蟲母體，通常一個胞囊能形成2000多個幼蟲母體，最后破囊而出，變成感染性幼蟲，此期幼蟲周身長有豐富的纖毛，借此游向魚體，依靠頭上的穿刺腺鉆入魚的皮膚和鰓，傳染性最強。如果1天～2天內沒有發現宿主，幼蟲會自行死亡，保持魚池清潔衛生對預防小瓜蟲病十分重要。治療方法：小瓜蟲病的治療一直是困擾鱒魚養殖的難題，特別是近幾年來，國家加強了對魚藥使用的管理，以前慣用的硝酸亞汞、孔雀石綠等嚴禁使用。我們采用以下方法治療小瓜蟲病：孵化室培育苗種期間（魚池小、換水快、操作方便）主要使用2%～3%食鹽溶液消毒20分鐘～40分鐘。在大池培育時，用300ppm辣椒粉汁液和300ppm生姜汁液浸洗30分鐘～60分鐘，以殺滅小瓜蟲。另外，每7天調換一次干凈魚池，降低再次感染小瓜蟲的機會，并用1ppm～1.5ppm二溴海因（10%）浸洗60分鐘，以預防繼發感染細菌和水霉。
　　三代蟲：主要發生在苗種培育后期，危害不大。癥狀：蟲體寄生在魚的體表、鰓部和鰭上。魚鰓浮腫、鰓蓋張開，鰓絲暗黑色，魚體色暗黑無光澤，離群緩游，病魚不攝食，逐漸瘦弱死亡。防治方法：可用3ppm～5ppm晶體敵百蟲浸洗40分鐘～60分鐘。