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“自交混繁法”采用自交保種、混系繁殖的生產技術。通過多代連續自交和選擇，提高品種的純度，減少個體間的遺傳差異，獲得一個較為純合一致的群體，生產出純度高的原種。

　　1．建立保種圃保種圃是自交混繁法生產棉花原種的核心，包括三個方面。

　　（1）單株選擇與自交以原種建立單株選擇圃，進行單株選擇和自交。根據品種的典型性狀選擇，第一次在蕾期，第二次在結鈴期，決選單株掛牌編號。

　　對于入選的單株，當中下部果技開花時進行自交，每株自交15～20朵花。一般每個品種自交400個單株，每株至少有5個正常吐絮的自交棉鈴。分株采收，記錄株號、鈴數。曬干后分株考種，根據單鈴重、絨長、衣分、子指、纖維整齊度等，從中決選單株200個左右。

　　（2）株行鑒定把上年決選單株的自交種子按順序種成株行，四周種植保護區。在生育期間，對主要性狀觀察記載。在初花期選擇形態性狀整齊一致、生長正常的株行，做好標志。在中部果枝開花時選株自交，每個當選株行的自交花數量＞30朵。在收獲前，再根據品種的典型性、豐產性、纖維品質及抗病性等進行鑒定，確定當選的株行。吐絮后，當選行分別采收正常吐絮的自交棉鈴，并注明株行號及采收鈴數。經室內考種，決選100個左右優良株行，妥善保存其種子。

　　（3）株系鑒定，建立保種圃將上年當選株行的自交棉鈴按株行編號分別種植，每一個株行的后代稱為一個株系。每個株系的種植株數，根據保種圃的面積確定。

　　在生育期間進行多次觀察記載，淘汰不符合要求的株系，入選株系進行嚴格的去雜去劣。開花期間在中選株系中選符合本品種典型性狀的優良單株，以內圍棉鈴為主進行人工自交。收花時，在田間進行復選，淘汰不良株系及單株。中選的自交棉鈴分株系混合收獲，軋花后得到各株系的自交系種子，分別裝袋，注明系號保存，下年仍以株系為單位種植于保種圃。

　　入選株系中未經人工自交的棉鈴，每株系選50～100個作室內考種樣品，其余混合收花留種。這兩部分種子即為核心種，作為下一年基礎種子田用種。

　　2．建立基礎種子田其目的是對上年的核心種進行擴大繁殖。基礎種子田應安排在保種圃的周圍，四周種植同一品種的原種生產田，以免發生生物學混雜。在整個生育期間，注意觀察個體的典型性和群體的整齊度，隨時進行去雜去劣。開花期任其自然授粉，成熟后隨機取樣進行室內考種、計產。所收獲的種子即為基礎種子，作為下年原種田用種。

　　3．建立原種生產田將基礎種子在隔離條件下，集中連片種植，即為原種生產田。在生育期間進行嚴格的去雜去劣，開花期自由授粉，成熟后混合收獲軋花的種子即為原種。