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選種后，曬種2-3天，搓掉種子茸毛，用25℃的溫水浸種30分鐘后利用 1000倍的高錳酸鉀或10倍的磷酸三鈉溶液浸種20分鐘后，反復清洗種子上的藥液。或用55℃溫水燙種10分鐘。種子消毒后用25-30℃溫水浸種 8-10小時。在28-30℃條件下催芽，2天后即可出齊芽。為達到早出苗、出齊苗、育壯苗的目的，播種前應對種子進行如下處理（任選一種即可）。

（1）高溫處理：將干燥種子放在70℃的溫箱里處理72小時，然后再浸種、催芽、播種，對番茄病毒病有一定防治效果。

（2）溫水浸種：利用熱水的熱力殺死附著和潛伏在種子表面及內部的病菌。這種方法簡便易行，節省成本，殺菌力強。目前，生產上普遍采用。具體做法是，先用清水浸泡種子1-2 小時，然后撈出倒入55℃左右溫水里浸泡5-10分鐘，之后再繼續浸種3-4小時。溫水浸種時，一是要注意水量，一般是1份種子2份水。二是要不斷、迅速地攪拌，使種子均勻受熱，以防燙傷種子。三是要不斷加熱水，保持55℃水溫。

（3）藥粉拌種：用70%敵克松粉劑拌種，用藥量為種子重量的0.3%，或用50%二氯萘醌可濕性粉劑拌種，用藥量為種子重量的0.2%，對防治番茄立枯病的發生有顯著功效。

（4）藥劑浸種：先用清水預浸種子3-4小時，再將濕籽放入10%磷酸三鈉中浸種20分鐘，然后用清水沖洗干凈，再進行催芽。磷酸三鈉浸種具有防治番茄病毒病的作用。目前生產上應用也較為普遍。或把預浸的種子放入1%高錳酸鉀溶夜中浸泡10-15分鐘，取出用清水沖洗干凈后再催芽，可防治番茄病毒病及潰瘍病。